一从事苗木种植的纳税人被税务机关要求认定为增值税一般纳税人，并使用防伪税控开具发票。该纳税人有些不理解，认为自产农产品免征增值税，销售对象也基本不要增值税发票，为什么要认定为增值税一般纳税人？日常经营中，发现一些从事自产农业产品的纳税人对相关税收政策及业务不了解，不知如何领购、开具发票及纳税申报。为此，我们对生产“免税农产品”涉及的相关税收政策进行整理归纳。

　政策规定

　　《增值税暂行条例》（以下简称条例）第十五条第一款规定，农业生产者销售的自产农产品免征增值税。农业是指种植业、养殖业、林业、牧业、水产业。农业生产者，包括从事农业生产的单位和个人。农产品，是指初级农产品。《财政部、国家税务总局关于农民专业合作社有关税收政策的通知》（财税[2008]81号）规定，对农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品，视同农业生产者销售自产农业产品免征增值税；对农民专业合作社向本社成员销售的农膜、种子、种苗、化肥、农药、农机，免征增值税。

销项税额
　　自产免税农业产品增值税一般纳税人使用增值税防伪税控系统开具增值税普通发票票面上是价税分离的，但事实上销售免税货物是不含税的，这与国有粮食企业销售政策性粮食免税类似。《国家税务总局关于国有粮食购销企业开具粮食销售发票有关问题的通知》（国税明电[1999]10号）规定，国有粮食购销企业开具增值税专用发票时，应当比照非免税货物开具增值税专用发票，企业记账销售额为“价税合计”数。尽管目前没有政策明确对自产农业产品免税开具增值税普通发票比照国有粮食企业执行。
　　自产免税农业产品的增值税一般纳税人开具增值税普通发票时，企业记账销售额为“价税合计”数，不计提销项税额，在进行增值税纳税时，其免税销售收入在增值税一般纳税人申报表第9栏填列，第11栏销项税额不进行填列。自产免税农业产品小规模纳税人销售货物应价税分离，计提销项税额，其减免的增值税转补贴收入，按规定申报所得税。
　　要注意，纳税人兼营免税、减税项目的，应当分别核算免税、减税项目的销售额；未分别核算销售额的，不得免税、减税。例如，某花木公司从事花卉苗木的种植、销售和承接一些园林景观工程项目等，2012年销售花木收入1270万元，其中自己种植的花木320万元、收购他入的花木950万元，取得合法票据可以抵扣的进项税金75万元，其中自己种植部分10.2万元。如果分开核算，应纳增值税＝（1270－320）×13%－（75－10.2）＝58.7（万元）；如果未分开核算，则应纳增值税＝1270×13%－75＝90.1（万元）。
　　进项抵扣
　　条例第八条规定，购进农产品，除取得增值税专用发票或者海关进口增值税专用缴款书外，按照农产品收购发票或者销售发票上注明的农产品买价和13%的扣除率计算进项税额。增值税一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，也可按13%的扣除率计算抵扣增值税进项税额。自产免税农业产品无论开具免税货物（劳务）发票，还是通过防伪税控系统开具增值税普通发票均属于“农产品销售发票”范围，其取得发票均可以计算进项税额，准予从销项税额中抵扣。

纳税申报
　　《财政部关于减免和返还流转税的会计处理规定的通知》（财会[1995]6号）第二条规定，对于直接减免的增值税，借记：应交税金应交增值税（减免税款），贷记：补贴收入。对于增值税一般纳税人，在“应交税金”科目下设置“应交增值税”明细科目，在“应交增值税”明细账中设置“进项税额”、“已交税额”、“销项税额”、“出口退税”、“进项转出”等项目。条例第十条规定，用于非增值税应税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物或者应税劳务的进项税额不得从销项税额中抵扣。因而自产免税农业产品的增值税一般纳税人进项税额不可抵扣，故其取得的增值税进项税额，只能进入存货的成本，在纳税时，其增值税一般纳税人申报表第12栏进项税额不进行填列。